秦时明月手游作为一款改编自经典动漫的卡牌策略游戏，虽然拥有精美的画面和丰富的玩法，但在实际游戏体验中仍存在一些负面效果的设计。这些设计在一定程度上影响了玩家的游戏体验，甚至可能导致部分玩家流失。
游戏中的资源获取机制存在明显的限制性设计。体力系统、关卡挑战次数和冷却时间等设定严格控制了玩家每日可获取的资源量，进而控制了玩家的成长速度。虽然这种设计可以延长游戏生命周期，但也让非付费玩家感到成长缓慢。铜币作为基础货币，其产出途径和数量受到严格限制，导致玩家在装备强化、技能升级等方面经常面临资源短缺的问题。元宝作为高级货币，免费获取渠道有限，大部分核心资源需要通过充值才能快速获得。
PVP玩法中的排名奖励机制存在不平衡现象。论剑系统和千机楼等PVP玩法中，高排名奖励被大R玩家牢牢占据，非付费玩家和小R玩家难以获得有吸引力的奖励。这种设计可能导致普通玩家失去竞争动力，进而降低参与度。杯赛系统中的奖励设置也存在类似问题，高价值奖励过于集中在前几名，中低排名玩家获得的奖励缺乏吸引力。狩魂玩法中由于资源争夺引发的玩家矛盾也屡见不鲜，影响了游戏社交环境的和谐。
游戏中的随机性设计有时会带来负面体验。奇遇系统中的云游商人和不期而遇事件，经常出现玩家不需要的物品，降低了系统的实用性。招募系统中的弟子获取存在较大随机性，可能出现重复获取低价值弟子的情况。装备强化材料的返还比例设置不合理，导致玩家不敢轻易更换装备，影响了装备系统的灵活性。这些随机性设计虽然增加了游戏的不确定性，但也可能让玩家感到挫败。
游戏中的部分系统存在体验不佳的问题。求学系统作为需要连续五天完成的任务，最终奖励往往与投入时间不成正比，降低了玩家的参与意愿。禁地寻宝活动中的海怪挑战，有时会出现无法在规定时间内完成的情况，导致玩家无法获得应有奖励。蜃楼玩法中投降机制的不完善，可能导致玩家被反复挑战而损失大量资源。这些系统设计上的不足，影响了玩家的游戏体验。
游戏更新和平衡性方面也存在一些问题。新推出的弟子或系统有时会打破原有的游戏平衡，导致玩家需要不断调整阵容和策略。部分技能或装备的实际效果与描述存在差异，影响了玩家的决策。游戏中的战力系统虽然直观，但也可能导致玩家过于注重数值而忽视策略搭配。这些因素都可能影响玩家对游戏的长期投入和热情。
